Como Centro Universitario, el CUD tiene entre sus prioridades, aparte de la docencia asignada, impulsar la innovación científica y la investigación de calidad, tanto fundamental como aplicada, para contribuir al desarrollo técnico y humanístico de la sociedad, con un especial énfasis en los temas que más preocupan a las Fuerzas Armadas: la paz, la seguridad y la defensa.
La investigación en el CUD se articula en torno a sus grupos de investigación y desarrollo. A continuación, se muestra la información de los mismos.